烟雾病最大的危害在于会导致脑梗或脑出血，且反复发作，脑梗之后也可能出现脑出血。儿童脑梗的几率较高一些，成年人脑出血的风险相对较高。
多数烟雾病患者脑梗之后只是针对脑梗进行治疗，没有处理烟雾病，等身体恢复了一些，后遗症好转了，就认为是烟雾病治好了，其实只是针对脑梗进行了治疗，实际上导致脑梗的原因并未得到解决，日后再来脑梗或出血的风险依然很大。
烟雾病的危害极大，严重者会出现生命危险，主要表现在大脑内缺血和出血两个方面，若烟雾病以出血为主，不进行治疗，脑室出血可引发急性脑积水，甚至导致颅内压急剧升高，从而出现生命危险。如烟雾病以缺血为主，则引发智力减退、偏瘫失语、癫痫等症状，不及时治疗，症状加重，则会导致死亡。
因此，烟雾病患者在早期时应积极进行治疗，谨遵医嘱，配合医生采取相应手术干预，降低脑出血、脑梗塞的发生率，改善脑供血，减少并发症。